ניתן לסווג דלקת בדרכי השתן כדלקת לא מורכבת או דלקת מורכבת עפ״י מיקום הדלקת בדרכי השתן וחומרתה.
סוג הדלקת משפיע על אופן הטיפול.
דלקת לא מורכבת בדרכי השתן
הנה דלקת שמוגבלת לדרכי השתן התחתונות (שלפוחית ושופכה) ושאינה גורמת לתופעות שחורגות מאזור זה.
דלקת מורכבת בדרכי השתן
הנה דלקת שיוצאת מגבולות דרכי השתן התחתונות (לדוגמא, מגיעה לכליות).
דלקת מורכבת, תלווה גם בתסמינים סיסטמיים כגון חום, צמרמורות, עייפות, כאבים בצידי הגב, כאבי אגן (בגברים).
למרבית הנשים יש דלקת פשוטה בדרכי השתן, כאשר אצל גברים וילדים הדלקת היא לרוב מורכבת.
סיווג הדלקת שונה בנשים בהריון ואנשים שעברו השתלת כליה, והטיפול שניתן לאנשים בקבוצות אלה עשוי להיות שונה.